Préchauffez votre four à 200°C.
Dans un grand bol, mélangez les rondelles d'oignons avec l'huile d'olive, le sel, le poivre et le thym séché jusqu'à ce qu'ils soient bien enrobés.
Disposez les andouillettes dans un plat de cuisson et répartissez les oignons assaisonnés autour et sur le dessus.
Étalez une fine couche de moutarde de Dijon sur le dessus de chaque andouillette.
Couvrez le plat de cuisson avec du papier aluminium et enfournez pendant environ 25 minutes.
Retirez le papier aluminium et laissez cuire encore 15 à 20 minutes, jusqu'à ce que les andouillettes soient dorées et que les oignons soient tendres et caramélisés.
Une fois cuit, sortez le plat du four et laissez reposer quelques minutes. Garnissez de persil frais haché avant de servir.
Servez chaud avec du pain croustillant ou des pommes de terre rôties.